Bezbolesny sposób na zainstalowanie nowej wersji R?

Jest to oczywiście stare pytanie, ale może być nowa łatwa odpowiedź (działa tylko dla Windows), którą właśnie znalazłem.

install.packages("installr")
require(installr)
updateR()

Najlepszym sposobem na to jest system RGui. Wszystkie twoje pakiety zostaną przeniesione do nowego folderu, a stare zostaną usunięte lub zapisane (możesz wybrać jeden z nich). Po ponownym otwarciu RStudio natychmiast rozpoznaje, że używasz zaktualizowanej wersji. Dla mnie to działało jak urok,

Więcej informacji na temat {installr} tutaj .

Simon

Dwie szybkie sugestie:

1. Użyj plików Batchfiles Gabora, które zawierają narzędzia pomagające np. w relokacji bibliotek. Zastrzeżenie: nie używałem ich.

2. Nie instaluj bibliotek w 'pliku' zainstalowanej wersji R. Na Windows, mogę umieścić R w C:/opt/R/R- $ version ale umieść wszystkie biblioteki w C:/opt/R/library / użycie poniższego fragmentu, ponieważ łagodzi problem w pierwszym miejsce:

$ cat .Renviron         # this is using MSys/MinGW which looks like Cygwin  
## Example .Renviron on Windows    
R_LIBS="C:/opt/R/library"

Metoda sugerowana powyżej nie będzie całkowicie działać, jeśli masz pakiety, które nie są z CRAN. Na przykład pakiet osobisty lub pakiet pobrany ze strony innej niż CRAN.

Moja preferowana metoda Na Windows (Aktualizacja 2.10.1 do 2.11.0):

1. Install R-2.11.0
2. skopiuj R-2.10.0/library/* do R-2.11.0/library/
3. Odpowiedz " nie " na monity z pytaniem, czy można zastąpić.
4. Start R 2.11.0
5. Uruchom polecenie R update.packages()

W odniesieniu do rozwiązania podanego w pytaniu, uruchomienie starszej wersji R może nie być łatwe, jeśli masz już zainstalowaną nową wersję. W takim przypadku możesz ponownie zainstalować wszystkie brakujące pakiety z poprzedniej wersji R w następujący sposób.

# Get names of packages in previous R version
old.packages <- list.files("/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library")

# Install packages in the previous version. 

# For each package p in previous version...
    for (p in old.packages) {
      # ... Only if p is not already installed
      if (!(p %in% installed.packages()[,"Package"])) {
        # Install p 
        install.packages(p) 
      }
    }

(zauważ, że argument list.files() w pierwszej linii kodu powinien być ścieżką do katalogu biblioteki dla twojej poprzedniej wersji R, gdzie znajdują się wszystkie foldery pakietów z poprzedniej wersji. W moim obecnym przypadku jest to "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library". Będzie inaczej, jeśli poprzednia wersja R nie jest 3.2 lub jeśli używasz systemu Windows.)

Instrukcja if upewnia się, że pakiet jest a nie zainstalowany, Jeśli

• jest już zainstalowany w nowej wersji R, lub
• został zainstalowany jako zależność od pakietu zainstalowanego w poprzedniej iteracji pętli for.

Zgodnie z sugestią Dirka, oto kod R do zrobienia tego na windows: Jak łatwo uaktualnić R na windows XP

Update( 15.04.11): napisałem kolejny post na ten temat, wyjaśniając jak radzić sobie z typowymi problemami Upgrade R w windows 7

Dwie opcje:

1. zaimplementuj moją odpowiedź tutaj
2. Jeśli używasz R pod Eclipse ze Statetem, otwórz Uruchom konfiguracje, Kliknij naConsole i w polu o nazwie R snippet Uruchom po uruchomieniu dodaj tę linię z wybranym katalogiem: .libPaths("C:/R/library")

Jestem na Windows 8 i z jakiegoś dziwnego powodu, nigdy nie mogę zainstalować pakietów za pomocą moich połączeń internetowych.

Generalnie instaluję go za pomocą .plik zip z CRAN.

Po prostu skopiowałem pakiety z

C:\Path\to\packa\R\win-library\3.2 do C:\Path\to\packa\R\win-library\3.3.

I ponownie uruchomiłem sesję R. Zadziałało idealnie. Nie sprawdzałem, czy wszystkie pakiety działają dobrze. Ale te, które sprawdziłem działają doskonale. Mam nadzieję, że ten hack działa dla wszystkich.

Przyjęta odpowiedź może zadziałać, jeśli masz dalekowzroczność, ale już pozbyłem się starej wersji, więc nie byłem w stanie podążać za tymi wskazówkami. Opisane poniżej kroki działały dla aktualizacji OSX z 2.1 i 3.1.

UPDATED: aby pobrać katalog dla Twojej ostatniej wersji (zamiast wpisywać w 3.1 lub 3.2) możesz użyć poniższych poleceń. Druga konwertuje bezpośrednio do zmiennej R, pomijając . i .. i .DS_Store, Użyj:

OLD=$(ls -d /Library/Frameworks/R.framework/Versions/*.* |tail -n 2 | head -n 1)Resources/library/
echo "packages = c(\"`ls $OLD | tail +4| paste -s -d ',' - | sed -E 's|,|\",\"|'g`\")" | tr -d "/"

Następnie w obrębie R Możesz wklej wygenerowaną zmienną (dodaj |pbcopy do końca, aby skopiować ją bezpośrednio. Po zdefiniowaniu w nowej wersji R, możesz przechodzić przez zainstalowane pakiety z powyższych instrukcji...

for (p in setdiff(packages, installed.packages()[,"Package"]))
   install.packages(p, dependencies=TRUE, quiet=TRUE, ask=FALSE)

Dla mnie ta strona jest dobra https://www.r-statistics.com/2013/03/updating-r-from-r-on-windows-using-the-installr-package/ lub inną opcją jest po prostu zainstaluj nową opcję i w końcu umieścić, na przykład w windows w moim komputerze

.libPaths (c( "D:/Documents/R/win-library/3.2", "C:/Program Files/R/R-3.2.3 / library", "C:/Program Files / R/R-3.2.0/library", "D:/Documents/R/win-library/2.15" )

Każda ścieżka ostatniej wersji w moim przypadku zawsze umieszczam pierwszą ścieżkę jest "D:/Documents/R/win-library/3.2" to jest naprawione a potem wstawiam drugi, ponieważ nie trzeba kopiować ani przenosić żadnych pakietów, w moim sugest po prostu nazwij to