Wykreśl wiele boxplot w jednym wykresie
Zapisałem swoje dane w pliku .csv
z 12 kolumnami. Kolumny od 2 do 11 (oznaczone F1, F2, ..., F11
) to features
. Column one
zawiera label
tych cech albo good
albo bad
.
Chciałbym narysować boxplot
z wszystkich tych 11 cech przeciwko label
, ale rozdzielić przez good
lub bad
. Mój kod do tej pory to:
qplot(Label, F1, data=testData, geom = "boxplot", fill=Label,
binwidth=0.5, main="Test") + xlab("Label") + ylab("Features")
Jednak to pokazuje tylko F1
przeciwko label
.
Moje pytanie brzmi: jak pokazać F2, F3, ..., F11
na tle label
w jednym wykresie z jakieś dodge position
? Znormalizowałem funkcje, więc są one w tej samej skali w zakresie [0 1].
Dane testowe można znaleźć proszę.. Narysowałem coś ręcznie, aby wyjaśnić problem (patrz poniżej).
6 answers
Powinieneś uzyskać dane w określonym formacie przez stopienie danych (zobacz poniżej, jak wyglądają stopione dane) przed wykreśleniem. W przeciwnym razie, to co zrobiłeś wydaje się być w porządku.
require(reshape2)
df <- read.csv("TestData.csv", header=T)
# melting by "Label". `melt is from the reshape2 package.
# do ?melt to see what other things it can do (you will surely need it)
df.m <- melt(df, id.var = "Label")
> df.m # pasting some rows of the melted data.frame
# Label variable value
# 1 Good F1 0.64778924
# 2 Good F1 0.54608791
# 3 Good F1 0.46134200
# 4 Good F1 0.79421221
# 5 Good F1 0.56919951
# 6 Good F1 0.73568570
# 7 Good F1 0.65094207
# 8 Good F1 0.45749702
# 9 Good F1 0.80861929
# 10 Good F1 0.67310067
# 11 Good F1 0.68781739
# 12 Good F1 0.47009455
# 13 Good F1 0.95859182
# 14 Good F1 1.00000000
# 15 Good F1 0.46908343
# 16 Bad F1 0.57875528
# 17 Bad F1 0.28938046
# 18 Bad F1 0.68511766
require(ggplot2)
ggplot(data = df.m, aes(x=variable, y=value)) + geom_boxplot(aes(fill=Label))
Edit: zdaję sobie sprawę, że być może będziesz musiał to ująć. Oto implementacja tego również:
p <- ggplot(data = df.m, aes(x=variable, y=value)) +
geom_boxplot(aes(fill=Label))
p + facet_wrap( ~ variable, scales="free")
Edit 2: Jak dodać x-labels
, y-labels
, title
, zmienić legend heading
, dodać jitter
?
p <- ggplot(data = df.m, aes(x=variable, y=value))
p <- p + geom_boxplot(aes(fill=Label))
p <- p + geom_jitter()
p <- p + facet_wrap( ~ variable, scales="free")
p <- p + xlab("x-axis") + ylab("y-axis") + ggtitle("Title")
p <- p + guides(fill=guide_legend(title="Legend_Title"))
p
Edytuj 3: Jak wyrównać geom_point()
wskazuje na środek pola-działki? Można to zrobić za pomocą position_dodge
. To powinno zadziałać.
require(ggplot2)
p <- ggplot(data = df.m, aes(x=variable, y=value))
p <- p + geom_boxplot(aes(fill = Label))
# if you want color for points replace group with colour=Label
p <- p + geom_point(aes(y=value, group=Label), position = position_dodge(width=0.75))
p <- p + facet_wrap( ~ variable, scales="free")
p <- p + xlab("x-axis") + ylab("y-axis") + ggtitle("Title")
p <- p + guides(fill=guide_legend(title="Legend_Title"))
p
Warning: date(): Invalid date.timezone value 'Europe/Kyiv', we selected the timezone 'UTC' for now. in /var/www/agent_stack/data/www/doraprojects.net/template/agent.layouts/content.php on line 54
2013-01-30 20:18:37
Używając Grafiki bazowej, możemy użyć at =
do kontrolowania pozycji skrzynki, w połączeniu z boxwex =
dla szerokości skrzynek. Pierwsza boxplot
instrukcja tworzy pusty wykres. Następnie dodaj 2 ślady w następujących dwóch stwierdzeniach.
Zauważ, że w poniższym przykładzie używamy df[,-1]
, aby wykluczyć 1.kolumnę (id) z wartości do wykresu. W przypadku różnych ramek danych może być konieczna zmiana tej wartości na podzbiór dla dowolnych kolumn zawierających dane, które chcesz fabuła
boxplot(df[,-1], boxfill = NA, border = NA) #invisible boxes - only axes and plot area
boxplot(df[df$id=="Good", -1], xaxt = "n", add = TRUE, boxfill="red",
boxwex=0.25, at = 1:ncol(df[,-1]) - 0.15) #shift these left by -0.15
boxplot(df[df$id=="Bad", -1], xaxt = "n", add = TRUE, boxfill="blue",
boxwex=0.25, at = 1:ncol(df[,-1]) + 0.15) #shift to the right by +0.15
Niektóre atrapy danych:
df <- data.frame(
id = c(rep("Good",200), rep("Bad", 200)),
F1 = c(rnorm(200,10,2), rnorm(200,8,1)),
F2 = c(rnorm(200,7,1), rnorm(200,6,1)),
F3 = c(rnorm(200,6,2), rnorm(200,9,3)),
F4 = c(rnorm(200,12,3), rnorm(200,8,2)))
Warning: date(): Invalid date.timezone value 'Europe/Kyiv', we selected the timezone 'UTC' for now. in /var/www/agent_stack/data/www/doraprojects.net/template/agent.layouts/content.php on line 54
2019-06-17 14:37:17
Ponieważ nie wspominasz o pakiecie fabularnym, proponuję tutaj użycie wersji Lattice
(myślę, że jest więcej odpowiedzi na ggplot2 niż kratowych, przynajmniej skoro tu jestem w SO).
## reshaping the data( similar to the other answer)
library(reshape2)
dat.m <- melt(TestData,id.vars='Label')
library(lattice)
bwplot(value~Label |variable, ## see the powerful conditional formula
data=dat.m,
between=list(y=1),
main="Bad or Good")
Warning: date(): Invalid date.timezone value 'Europe/Kyiv', we selected the timezone 'UTC' for now. in /var/www/agent_stack/data/www/doraprojects.net/template/agent.layouts/content.php on line 54
2013-01-30 14:44:41
Ggplot wersja kraty działki:
library(reshape2)
library(ggplot2)
df <- read.csv("TestData.csv", header=T)
df.m <- melt(df, id.var = "Label")
ggplot(data = df.m, aes(x=Label, y=value)) +
geom_boxplot() + facet_wrap(~variable,ncol = 4)
Fabuła:
Warning: date(): Invalid date.timezone value 'Europe/Kyiv', we selected the timezone 'UTC' for now. in /var/www/agent_stack/data/www/doraprojects.net/template/agent.layouts/content.php on line 54
2013-01-31 07:44:54
Wiem, że jest to trochę starsze pytanie, ale to też miałem, i chociaż zaakceptowane odpowiedzi działają, istnieje sposób, aby zrobić coś podobnego Bez za pomocą dodatkowych pakietów, takich jak ggplot lub lattice. Nie jest to aż tak miłe w tym, że boxploty nakładają się na siebie, a nie pokazują się obok siebie, ale: {]}
boxplot(data1[,1:4])
boxplot(data2[,1:4],add=TRUE,border="red")
To umieszcza w dwóch zestawach kartonów, przy czym drugi ma kontur (bez wypełnienia) w kolorze czerwonym, a także umieszcza wartości odstające w kolorze czerwonym. The nice thing is, działa dla dwóch różnych ram danych, zamiast próbować je przekształcić. Szybki i brudny sposób.
Warning: date(): Invalid date.timezone value 'Europe/Kyiv', we selected the timezone 'UTC' for now. in /var/www/agent_stack/data/www/doraprojects.net/template/agent.layouts/content.php on line 54
2016-08-26 16:05:26
W bazie R można użyć interfejsu formula_1 z oddziaływaniami (:
).
df <- read.csv("~/Desktop/TestData.csv")
df <- data.frame(stack(df[,-1]), Label=df$Label) # reshape to long format
boxplot(values ~ Label:ind, data=df, col=c("red", "limegreen"), las=2)
Warning: date(): Invalid date.timezone value 'Europe/Kyiv', we selected the timezone 'UTC' for now. in /var/www/agent_stack/data/www/doraprojects.net/template/agent.layouts/content.php on line 54
2018-10-08 12:42:35