Jak mam poradzić sobie z ostrzeżeniem "pakiet 'xxx' nie jest dostępny (dla wersji R X.y.z)"?

W najnowszym R (3.2.3)jest błąd, który uniemożliwia mu znalezienie poprawnego pakietu. Obejście problemu polega na ręcznym ustawieniu repozytorium:

install.packages("lubridate", dependencies=TRUE, repos='http://cran.rstudio.com/')

Znaleziono rozwiązanie w inne pytanie

To rozwiązanie może złamać R, ale tutaj jest najprostsze rozwiązanie, które działa 99% czasu.

Musisz zrobić to tylko:

install.packages('package-name',repos='http://cran.us.r-project.org')

Jak wspomniano przez autora nad tutaj

Wydaje się, że istnieje problem z niektórymi wersjami R i libcurl. Miałem ten sam problem na Mac (R version 3.2.2) i Ubuntu (R version 3.0.2) i w obu przypadkach został rozwiązany po prostu uruchamiając to przed install.packages poleceniem

options(download.file.method = "wget")

Rozwiązanie zostało zasugerowane przez znajomego, jednak nie udało mi się go znaleźć na żadnym z forów, dlatego odpowiedź dla innych.

11. R (lub inna zależność) jest nieaktualna i nie chcesz jej aktualizować.

Warning {[10] } to nie jest do końca najlepsza praktyka.

• Pobierz źródło pakietu.
• przejdź do pliku DESCRIPTION.

• Usuń obraźliwą linię za pomocą edytora tekstu, np.

  Depends: R (>= 3.1.1)
  

• Instaluj z lokalnego (tzn. z katalogu nadrzędnego DESCRIPTION) np.

  install.packages("foo", type="source", repos=NULL)
  

1. wizyta https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/.
2. Znajdź pakiet, który chcesz zainstalować za pomocą Ctrl + F
3. kliknij nazwę pakietu
4. Określ, którą wersję chcesz zainstalować
5. Open RStudio
6. Typ "install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/[NAME OF PACKAGE]/[VERSION NUMBER].tar.gz", repos = NULL, type="source")"

W niektórych przypadkach, aby użyć pakietu, którego chcesz użyć, musisz wcześniej zainstalować kilka pakietów.

Na przykład, musiałem zainstalować 7 pakietów(Sejong, hash, rJava, tau, RSQLite, devtools, stringr) aby zainstalować pakiet KoNLP.

install.packages('Sejong')
install.packages('hash')
install.packages('rJava')
install.packages('tau')
install.packages('RSQLite')
install.packages('devtools')
install.packages('stringr')

library(Sejong)
library(hash)
library(rJava)
library(tau)
library(RSQLite)
library(devtools)
library(stringr)

install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/KoNLP/KoNLP_0.80.2.tar.gz", repos = NULL, type="source")
library(KoNLP)

Jedna rzecz, która mi się przydarzyła, to to, że wersja R dostarczona przez moją dystrybucję Linuksa (wersja R 3.0.2 dostarczona przez Ubuntu 14.04) była za stara na najnowszą wersję pakietu dostępnego na CRAN (w moim przypadku, plyr wersja 1.8.3 na dzień dzisiejszy). Rozwiązaniem było użycie systemu pakowania mojej dystrybucji zamiast próby instalacji z R (apt-get install r-cran-plyr dostałem wersję 1.8.1 z plyr). Może mógłbym spróbować zaktualizować R używając updateR(), ale obawiam się, że to mogłoby kolidować z moim menedżer pakietów dystrybucji.

Edit (04/08/2020): ostatnio miałem problem z pakietem (XML), który podobno nie jest dostępny dla mojej wersji R (3.6.3, najnowsza obsługiwana na debian stretch), po aktualizacji pakietu w CRAN. Było to bardzo nieoczekiwane, ponieważ już wcześniej zainstalowałem go z sukcesem (na tej samej wersji R i tym samym systemie operacyjnym).

Z jakiegoś powodu pakiet nadal tam był, ale install.packages przyglądał się tylko zaktualizowanej (i niezgodnej) wersji. Rozwiązanie aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.]}

install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/XML/XML_3.99-0.3.tar.gz", repos=NULL, type="source", ask=FALSE)

Zaoszczędziło mi to dużo czasu na debugowanie tego, co jest nie tak. W wielu przypadkach są po prostu lustra nieaktualne. Ta funkcja może instalować wiele pakietów z ich zależnościami używając https://cran.rstudio.com/:

packages <- function(pkg){
    new.pkg <- pkg[!(pkg %in% installed.packages()[, "Package"])]
    if (length(new.pkg))
        install.packages(new.pkg, dependencies = TRUE, repos='https://cran.rstudio.com/')
    sapply(pkg, require, character.only = TRUE)
}

packages(c("foo", "bar", "baz"))

To jest to, co w końcu mogłem zrobić, aby zainstalować pakiet psych w R-3.4.1, gdy dostałem to samo ostrzeżenie

1:

2: ściągnąłem ręcznie mając tar.rozszerzenie gz

3: Wybierz opcję " plik archiwum pakietu (.zip;.smoła.gz) " Dla pakietów instalacyjnych w R

4: przeglądanie lokalnie do miejsca, w którym został pobrany i kliknij Zainstaluj

Możesz otrzymać ostrzeżenie: zależności ' xyz ' nie są dostępne dla pakietu, następnie najpierw zainstaluj te z repozytorium, a następnie wykonaj kroki 3-4 .

Naprawiłem ten błąd na Ubuntu, uważnie postępując zgodnie z instrukcją instalacji R. W tym:

1. dodanie deb http://cran.utstat.utoronto.ca/bin/linux/ubuntu trusty/ do mojego /etc/apt/sources.plik listy
2. Running sudo apt-get update
3. Running sudo apt-get install r-base-dev

W kroku 1 możesz wybrać dowolny Cran download mirror zamiast mojego Uniwersytetu w Toronto, jeśli chcesz.

Popełniłem błąd zapominając umieścić repos=NULL podczas instalacji pakietu R z kodu źródłowego. W tym przypadku komunikat o błędzie jest nieco mylący: package 'foobarbaz' is not available (for R version x.y.z)

Problemem nie była wersja R, tylko parametr repos. Zrobiłem {[3] } co mi się przy tej okazji przydało.

Miałem ten sam problem (na Linuksie), który można było rozwiązać zmieniając ustawienia proxy. Jeśli jesteś za serwerem proxy sprawdź konfigurację używając Sys.getenv("http_proxy") w R. W moim ~/.Renviron miałem następujące linijki (od https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200488488-Configuring-R-to-Use-an-HTTP-or-HTTPS-Proxy) powoduje problem:

http_proxy=https://proxy.dom.com:port
http_proxy_user=user:passwd

Zmiana na

http_proxy="http://user:[email protected]:port"

To nie była pierwsza myśl, kiedy przeczytaj "pakiet xxx nie jest dostępny dla wersji r-x-y-z" ...

HTH

Another reason + solution

Podczas próby instalacji pkgdown w moim RStudio na HPC mojej firmy napotkałem ten błąd ("pakiet XXX nie jest dostępny dla wersji R X. X. X").

## checking the specific repos you currently have
getOption("repos")

## updating your CRAN snapshot to a newer date
r <- getOption("repos")
r["newCRAN"] <- "https://cran.microsoft.com/snapshot/*2019-11-07*/"
options(repos = r)

## add newCRAN to repos you can use
setRepositories()

Jeśli wiesz, co robisz i możesz potrzebować więcej niż jednego pakietu, który może nie być dostępny w CRAN Twojego systemu, możesz to skonfigurować w swoim projekcie .Rprofile.

Jeśli to tylko jeden pakiet, może po prostu użyj install.packages("package name", repos = "a newer CRAN than your company's archaic CRAN snapshot").

To prawie zawsze działa dla mnie, gdy używam bioconductor jako źródła, a następnie powołuję biocLite. Przykład:

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("preprocessCore")

Znalazłem lekką odmianę #6 Pakiet jest nieaktualny z doskonałego rozwiązania autorstwa @Richie Cotton.

Czasami opiekun pakietu może pokazać luki w wersji R, których nie obsługuje. W takim przypadku masz co najmniej dwie opcje: 1) zaktualizuj swoją wersję R do następnej, którą obsługuje już pakiet docelowy, 2) Zainstaluj najnowszą wersję ze starszych dostępnych, które będą działać z twoją wersją R.

Konkretny przykład: najnowsza wersja CRAN Pakiet rattle dla eksploracji danych, 5.3.0, nie obsługuje wersji R 3.4, ponieważ miał dużą aktualizację między wersjami pakietów 5.2.0 (R >= 2.13.0) i 5.3.0 (r >=3.5).

W takim przypadku alternatywą dla aktualizacji instalacji R jest już wspomniane rozwiązanie. Zainstaluj pakiet devtools, jeśli go nie masz (zawiera pakiet remotes), a następnie zainstaluj konkretną wersję, która będzie działać w bieżącym R. możesz wyszukać te informacje na stronie CRAN dla konkretnego archiwum pakietów.

library("devtools")
install_version("rattle", version = "5.2.0", repos = "http://cran.us.r-project.org")

W moim przypadku rozwiązaniem było po prostu upgrade R.

Kolejny drobny dodatek, podczas próby przetestowania starej wersji R przy użyciu obrazu dokera rocker/r-ver:3.1.0

1. domyślnym ustawieniem repos jest MRAN i nie można uzyskać wielu pakietów.
2. Ta wersja R nie ma https, więc na przykład: Wygląda na to, że działa.

Jak wspomniano tutaj (w języku francuskim), może się to zdarzyć, gdy masz dwie wersje r zainstalowane na komputerze. Odinstaluj najstarszy, a następnie spróbuj ponownie zainstalować pakiet! Dla mnie zadziałało.