dna-sequence
Ile miejsca będzie potrzebne do przechowywania ludzkiego genomu?
Szukam ilości pamięci w bajtach (MB, GB, TB itp.) wymagane do przechowywania pojedynczego ludzkiego genomu. Czytałem kilka ar ... zumiem, że będzie to przybliżenie, więc szukam minimalnej wartości, która byłaby w stanie przechowywać DNA każdego człowieka.
Jak wykreślić wykres genu dla sekwencji DNA powiedzmy ATGCCGCTGCGC?
Muszę wygenerować losowy spacer na podstawie sekwencji DNA wirusa, biorąc pod uwagę sekwencję par zasad 2k. Sekwencja wygląda ... a skręcić w prawo na A, w lewo na T, iść w górę na G i w dół na C.
Jak Mogę używać do tego celu Matlab, Mathematica lub SPSS?
Wyszukiwanie ciągu pozwalającego na jedną niedopasowanie w dowolnym miejscu łańcucha
Pracuję z sekwencjami DNA o długości 25 (patrz przykłady poniżej). Mam listę 230 000 i muszę poszukać każdej sekwencji w cały ... kacjach.
Oto podobny post dla Perla, chociaż porównują one tylko sekwencje i nie przeszukują ciągów ciągłych:
Related post